Trên đà hội nhập, đổi mới và phát triển, ngày 29/5/2009 Bộ trưởng Bộ Giáo dục và Đào tạo đã ban hành quyết định số 3903/QĐ-BGDĐT thành lập Viện Cơ khí trên cơ sở Khoa Cơ khí và Trung tâm thực hành công nghệ cơ khí. Viện Cơ khí là một tổ chức đào tạo, khoa học và công nghệ của ĐHBKHN. Sự đổi mới mô hình tổ chức và hoạt động đáp ứng yêu cầu phát triển trong giai đoạn mới.